苹果酸脱氢酶广泛存在于动植物、微生物和培养细胞中，依据需要的辅酶不同，可分为：NAD-MDH和NADP-MDH，前者主要存在于线粒体和胞质中，后者存在于某些微生物和植物叶绿体中；苹果酸脱氢酶与多条生理代谢途径密切相关：线粒体的能量代谢、 苹果酸-天冬氨酸穿梭系统、活性氧代谢和抗病性等。
NADP-MDH（EC 1.1.1.82）催化NADPH还原草酰乙酸生成苹果酸，使NADPH在340nm处光吸收下降，进而通过340nm处光吸收的下降速率计算得到NADP-MDH的酶活性大小。