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m6A microRNA甲基化测序
  • CX-004
  • 云序生物
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  • 2022-07-21 14:31:55

上海云序生物科技有限公司

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技术简介

MicroRNAs(miRNAs)是一类广 泛存在于真核生物中,长度为~22nt的单链小分子非编码RNA,在转录后的基因调控中发挥作用。它们广 泛参与细胞增殖、凋亡、分化等生理过程。目前研究发现,miRNA能够发生m6A甲基化修饰,不仅能够改变其稳定性,而且能改变与靶mRNA的识别及结合能力,调控mRNA降解或翻译,在各种重大人类疾病中发挥关键的调控作用,并具有作为新型临床分子标志物的潜能。

技术原理

云序生物提供miRNA MeRIP-Seq技术服务。 技术原理如下:提取total RNA后,利用small RNA纯化试剂盒提纯small RNA(包括miRNA);将m6A RNA甲基化特异性抗体与RNA进行共孵育,抓取有甲基化修饰的片段进行测序;同时需要平行测序一个对照(Input)样本,对照样本为未进行IP反应的RNA。对照样本用于消除非特异性抓取甲基化片段的背景。对比免疫共沉淀IP样本和Input样本中的序列片段,将miRNA m6A甲基化修饰位点定位到转录组上,并计算样本中miRNA m6A甲基化程度。

配合专业的生物信息学分析,云序生物可进一步提供高精度的miRNA m6A甲基化图谱,帮助客户揭示miRNA m6A甲基化在生物学功能和潜在的作用机制。

云序优势

一站式服务

客户只需提供组织、细胞、体液样品或RNA,云序生物为您完成从miRNA m6A富集,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。

抗体富集效率高

MeRIP-seq的富集效率是决定数据质量的关键,云序生物MeRIP-seq实验采用预验证的商业化抗体和精心优化的实验流程,具有极高的效率和特异性。

严格的质控

云序生物对MeRIP-seq实验每一步骤均设有关键质控,全程监控实验质量,保证客户得到优 质数据。

专业的生物信息学分析

云序生物拥有专业的生物信息分析团队,帮助客户进行实验数据的全 面挖掘。

样品要求

样品类型

细胞、组织或RNA,其他样本类型及样品量请电询。

样品量 

a) 细胞:2×107 

b) 组织:100 mg-1 g

c) RNA:30-300 μg(OD260/280:1.6-2.3;RNA无明显降解28S:18S>1.5或RIN>7)

 

样品运输与保存

样品运输:样品置于1.5mL离心管中,封口膜封好,干冰运输。
样品保存:细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后-80℃保存;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,避免反复冻融。

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