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O8G RNA氧化修饰测序
  • ZL-002
  • 云序生物
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  • 2022-07-21 14:31:44

上海云序生物科技有限公司

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背景介绍
O8G RNA氧化修饰是在哺乳动物细胞内活性氧攻击mRNA中的鸟嘌呤从而产生的一种RNA修饰,它可以与腺嘌呤配对并诱导鸟嘌呤-胸腺嘧啶(G> T)突变,是病理生理学中一种通过活性氧氧化导致疾病表型的修饰。目前,O8G RNA氧化修饰作为一类新型RNA修饰,是继m6A修饰之后的又一表观转录组学热点和“超级潜力股”!
云序生物对O8G RNA氧化化检测手段为O8G-IP-Seq技术,技术原理如下: 将O8G特异性抗体与被随机打断的RNA片段进行共孵育,抓取有O8G修饰的片段进行测序;同时需要平行测序一个对照(Input)样本,对照样本只含有打断的RNA片段,并不添加O8G特异性抗体与其共孵育。对照样本用于消除非特异性抓取的O8G片段的背景。对比免疫共沉淀(IP)样本和对照样本(Input)中的序列片段,将O8G氧化修饰位点定位到转录组上,并根据RNA-seq数据,计算样本中O8G氧化程度及对RNA表达水平的影响。



技术原理
为了系统性揭示RNA O8G氧化修饰,云序生物提供了成熟的 RNA O8G氧化MeRIP-Seq技术服务。技术原理如下:将RNA O8G氧化特异性抗体与被随机打断的RNA片段进行共孵育,抓取有O8G氧化修饰的片段进行测序;同时需要平行测序一个对照(Input)样本,对照样本为未进行IP反应的RNA片段。对照样本用于消除非特异性抓取O8G氧化片段的背景。对比免疫共沉淀IP样本和Input样本中的序列片段,将O8G氧化修饰位点定位到转录组上,并根据RNA-seq数据,计算样本中O8G氧化程度。
配合专业的生物信息学分析,云序生物可进一步提供高精度的O8G氧化图谱,帮助客户揭示O8G氧化在生物学功能和潜在的作用机制。

云序特色
√ 最全产品线:可针对性地检测不同类型RNA分子的O8G氧化;
√ 特异性高:特异性富集和检测O8G氧化的 RNA片段;
√ 全转录组覆盖:全转录组范围的RNA O8G氧化检测;
√ 全物种检测:可以检测几乎任何动植物的O8G氧化;
√ 专业化的生信分析:强大的生信团队,专业的O8G氧化数据分析;




产品分类
O8G 全转录组测序:同时检测O8G氧化的环状RNA,LncRNA和mRNA;
O8G 环状RNA测序:检测O8G氧化的所有环状RNA;
O8G LnRNA测序:同时检测O8G氧化的LncRNA和mRNA;
O8G mRNA测序:检测O8G氧化的所有mRNA;



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