m1A全转录组测序
- cloud-seq-003
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- 2022-06-16 17:01:12
上海云序生物科技有限公司
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技术简介
m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化，即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰。研究表明，m1A是真核生物tRNA和rRNA丰度很高的一种转录后修饰，近期研究也表明m1A修饰可调控mRNA翻译。m1A修饰作为一类新型RNA甲基化，其功能和机制都亟待挖掘。
与m6A RNA检测方式一致，针对m1A修饰也采用MeRIP-seq技术，抗体富集的技术原理如下：将m1A RNA甲基化特异性抗体与被随机打断的RNA片段进行共孵育，抓取有甲基化修饰的片段进行测序；同时需要平行测序一个对照（Input）样本，对照样本为未进行IP反应的RAN片段，对照样本用于消除非特异性抓取甲基化片段的背景。
云序生物m1A RNA-seq实验流程
产品列表
云序优势
技术优势：
可单碱基分辨率检测m1A甲基化修饰。
特异性高：
m1A RNA-seq采用商业化m1A抗体，可特异性富集m1A修饰片段。
一站式服务：
客户只需提供细胞、组织、体液或总RNA，云序生物为您完成从m1A RNA-seq富集、文库制备、上机测序到数据分析的整套服务流程。
专业的生物信息学分析：
云序生物具有强大的生物信息学团队，能够满足客户的各类深入数据分析要求。
样本要求
样品类型：
组织、细胞、体液或RNA样品。其它类型样品请详询。
样品量：
细胞： > 1×108
组织： > 5 g
总RNA：> 300 μg (OD260/280≥1.8；OD260/230≥1.5；无明显降解，电泳检测样品特征性条带完整清晰，无明显弥散或拖尾 28S：18S≥1.5或者RIN≥7）
样品运输及保存：
样品运输：样品置于1.5mL离心管中，封口膜封好，干冰运输。
样品保存：细胞样品或新鲜组织块（切成5-10 mg的小块），可用TRIZOL或RNA保护剂处理，液氮冻存后，-80℃保存，RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中，-80℃保存，样品保存期间避免反复冻融。
数据分析（下列有※表示个性化分析）
1、RNA甲基化富集峰分布图※
2、RNA甲基化位点motif分析※
3、RNA甲基化富集峰可视化图
4、差异甲基化区的GO和KEGG信号通路分析
