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2x Realab Green PCR Fast mixture通用型(定量试剂盒)
  • R0202-100T
  • Lablead/兰博利德
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  • 2022-07-14 09:30:36

北京兰博利德商贸有限公司

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Taq SYBR® Green qPCR Premix (通用型) 

 

产品货号:R0202

储存条件:长期保存请于 -20℃避光保存,Mix 融解后可在 4℃避光条件下稳定存放一个月,尽量避免反复冻融。

 

产品简介

Taq SYBR® Green qPCR Premix 是 SYBR® Green I 嵌合染料法专用qPCR试剂,为2×预混液,包含除引物和DNA样品以外的所有qPCR组分,可减少操作步骤,缩短加样时间,降低污染几率。其核心组分是经抗体修饰的热启动Taq DNA聚合酶,配合精心优化的Buffer体系以及PCR反应促进因子,使产品具有特异性强、扩增效率高等特点,有效抑制非特异性扩增,可对宽广浓度范围的模板进行准确定量,获得稳定可靠的qPCR结果。

 

使用方法

1.适配机型

全机型通用

2.使用注意

① 因Mix中预混有染料,其保存或反应体系配制过程应避免强光照射;

② 使用前上下颠倒轻轻混匀Mix,请勿涡旋振荡混匀,避免产生过多气泡。

3.建议的qPCR反应体系

试剂

使用量

终浓度

Taq SYBR® Green qPCR Premix

10ul

正向引物 (10uM)a

0.4ul

0.2uM

反向引物(10uM)a

0.4ul

0.2uM

DNA模板b

X ul

10~200 ng/20ul

Nuclease-Free Water

To 20ul

 

 

a.调通推荐的引物终浓度为0.2uM,反应效果不佳时可在0.1~1uM范围内进行调整;

b.推过荐模板加样量的为1~2ul,如模板类型为未稀释cDNA原液,模板添加量不应超过总反应体系的10%,不同种类DNA模板中含有的靶基因拷贝数目不同,必要时可进行梯度稀释,以确定必要的DNA模板添加量。

4.qPCR 反应程序(可根据机型适当调整)

两步法:

40 cycles

步骤

温度

时间

预变性

95℃

30 sec

变性

95℃

10 sec

退火&延伸a

60℃

30 sec

熔解曲线b

使用仪器默认采集程序

 

三步法:

40 cycles

步骤

温度

时间

预变性

95℃

30 sec

变性

95℃

10 sec

退火a

55 ~ 65℃

10 sec

延伸a

72℃

30 sec

熔解曲线b

使用仪器默认采集程序

a.根据引物的Tm值进行退火&延伸(退火)温度的设定;若扩增片段在200bp以内,退火&延伸(延伸)时间可以设置为15sec;此外,退火&延伸(延伸)时间的设置还需根据您使用的qPCR仪所需的最短数据采集时间自行调整;

b.不同 qPCR 仪的熔解曲线采集程序有差别,一般可使用仪器默认的熔解曲线采集程序。

 

5.实验优化

若使用默认反应条件反应性能不佳时,则需要进行反应条件的优化,可以从引物浓度以及扩增程序两个方面进行:

① 引物浓度调整

当引物终浓度在0.1~1.0uM范围之间变化时,引物浓度越低,扩增特异性越高,但扩增效率会有所下降。

② 扩增程序优化

需提高扩增特异性,可使用两步法程序或提高退火温度;需提高扩增效率,可使用三步法程序或延长延伸时间。

 

6.引物设计原则

① 扩增产物长度建议控制在80~200bp;

② 引物长度为18~25bp;

③ 正向引物和反向引物的Tm值相差不超过 1℃为佳,Tm值控制在58~62℃为佳;

④ 引物的GC含量控制在 40%~60% 之间;

⑤ 引物A、G、C、T整体分布尽量要均匀,避开T/C或者A/G的连续结构(特别是3'端);

⑥ 引物3'端最后一个碱基最好为G或者C;

⑦ 避开引物内部或者两条引物之间的互补序列;

⑧ 使用NCBI BLAST功能检索确认引物的特异性。

 

问题描述

可能原因

解决办法

扩增曲线不光滑

荧光信号太弱,经系统校正后产生

确保Mix中预混的染料未降解;更换荧光信号收集更好的qPCR专用耗材

扩增曲线断裂或下滑

模板浓度较高,基线的终点值大于Cq 值

减小基线终点(Cq-4),重新分析数据

个别孔扩增曲线突然骤降

反应管内留有气泡

确保Mix完全溶解,请勿涡旋振荡混匀

加样完成后轻弹离心去除气泡

延长预变性时间至10min,以去除气泡

 

反应结束无扩增曲线出现

反应循环数偏少

设置循环数为40,但更多的循环数会增加过多的背景信号

荧光信号采集步骤未设置或者设置错误

两步法扩增程序一般将信号采集设置在退火&延伸阶段,三步法扩增程序应当将信号采集设置在72℃延伸阶段

引物可能降解

长期未用的引物,应先通过PAGE电泳检测完整性,以排除其降解的可能

模板浓度过低

减少模板稀释倍数重复实验,样品浓度未知的情况下先从最高浓度做起

模板降解

重新制备模板,重复实验

 

Cq 值出现过晚

扩增效率低

提高引物浓度,尝试三步法扩增程序,或者重新设计引物

模板浓度过低

减少模板稀释倍数重复实验,样品浓度未知的情况下先从最高浓度做起

模板降解

重新制备模板,重复实验

扩增产物过长

扩增产物长度控制在80~200 bp

体系中存在 PCR 抑制剂

一般为模板带入,加大模板稀释倍数或重新制备纯度高的模板重复实验

 

空白对照出现信号

反应体系污染

首先更换空白对照的水,如果还发生同样情况,继续更换引物、吸头、PCR

管或启用新的Mix;反应体系在超净工作台内配制,减少气溶胶污染

出现引物二聚体等非特异性扩增

一分般析在 35 循环以后空白对照出现扩增产物属正常情况,应配合熔解曲线进行重新设计引物,调整引物浓度或优化PCR反应程序

 

熔解曲线出现多峰

引物设计不佳

根据引物设计原则重新设计新引物

引物浓度过高

适当降低引物浓度

cDNA 模板存在基因组污染

提取后的RNA溶液使用DNA酶进行消化,例如:dsDNase,以去除基因组污染,或设计跨内含子引物

 

实验重复性差

加样误差大

使用精准的移液器、配合高品质吸头准确移液

高倍稀释模板,加入大体积模板减少加样误差

放大qPCR反应体积

模板浓度过低

减少模板稀释倍数重复实验

qPCR仪不同位置的温度偏差

定期校准qPCR仪

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