发布需求
请登录 注册
免疫组库测序
  • MSYL-10
  • 铭时医疗
  • 浙江省宁波市
  • 一个月内
  • 按需
  • 议价
  • 2023-02-20 15:24:22

铭时医疗科技(宁波)有限公司

一键申请试用
咨询
加入意向单
联系方式
免疫组库(immune repertoire, IR):是指个体在特定时间点其循环系统中所有功能多样性B淋巴细胞和T淋巴细胞的总和。
免疫组库分析:通过分析决定B细胞受体(B cell receptor, BCR)或T细胞受体(T cell receptor, TCR)多样性的互补决定区(CDR区),全面评估免疫系统的多样性,深入挖掘免疫组库与疾病的关系。
T淋巴细胞(T cell)和B淋巴细胞(B cell)主要负责适应性免疫应答,其抗原识别主要依赖于T细胞受体(T cell receptor, TCR)和B细胞受体(B cell receptor, BCR),TCR由α、β两条肽链组成,BCR是由两条重链和两条轻链组成。
编码轻链(α链)的基因簇上分别有L, V, J,C 四类基因片段。其中L是前导片段(leader segment), V是可变片段(variable segment) ,J代表链接片段(joining segment), C代表恒定片段(constant segment)。编码重链(β链)的基因簇上有五类基因片段, 比α链多出来的是 D(diversity segment)多样性片段。同时,在重链的J和C片段之间存在增强子,并且重链的C区决定抗体亚型。
在胚胎细胞中,V、J、D和C基因是分散排列的,在B细胞发育成熟过程中,基因组中组成免疫球蛋白分子的各个基因开始发生重排:在轻链上V区基因发生V-J重排, 而在重链上先是D片段和J片段相连, 然后V片段链接上D-J片段, 形成V-D-J复合体。最后它们都会和C基因链接, 完成基因重排,转录并翻译成蛋白。然后重链和轻链复合, 完成加工并运输锚定在细胞膜上。
由于重排过程选择的片段是随机的,所以随机重排的结果可以产生108-10种免疫球蛋白分子。其次, 淋巴细胞在成熟后还会发生体细胞突变, 又极大的增加了抗体的多样性。综合来看, H链和L链可能的组合数预计可达1011以上,这是我们的肌体可以抵御复杂体外环境微生物侵袭感染的重要机制。
 
图 1. 免疫球蛋白的基因重排以及BCR、TCR的生成。图片引自Cancer Lett. 2018;416:42-56.
 
技术路线
 
分析内容
1、测序数据质量评估;
2、比对与注释:样本基本信息结果统计,样本contig注释信息结果统计,样本consensus序列注释信息结果统计;
3、Clonotype分型;
4、多样性分析:样本间Clonotype比较,Overlapping Clonotype聚类分析,Overlapping Clonotype差异分析
5、单细胞测序选项:CDR3特征分析,V/J基因特征分析,V-J paired特征分析
 
应用方向
肿瘤:肿瘤免疫治疗评估;
自身免疫性疾病:免疫病病程研究,药物作用机制,诊断biomarker等;
抗体评估:抗体库测序,群体免疫反应评估;
感染性疾病:感染过程中免疫动态变化,病原感染biomarker,药物作用机制;
移植:受体免疫重构研究,排异反应研究。
 
样本类型
外周血、细胞悬液,胸腹水,组织等

发布需求

意向单

反馈

400-661-8020

扫码关注订阅号
返回顶部